Juan Morata Cantón nació en Almería en 1899. Tras finalizar sus estudios de Medicina, ejerció como médico titular en La Losa (Segovia) en 1924, en Ezcaray (La Rioja) en 1926, y desde 1928 trabajó como ginecólogo en la Mutua Obrera Sanitaria de la Confederación Nacional del Trabajo (CNT) en Madrid.
Entre 1929 y 1936 fue director de la Clínica Madrid. Procedente de la UGT, a la que se afilió al llegar a Madrid, en abril de 1932 se integró en la CNT madrileña, en el Sindicato Único de Sanidad.
Fue presidente de la Sección de Médicos y secretario del Sindicato en tres etapas distintas.
Al estallar la guerra, el Comité de Defensa le encargó organizar la sanidad de las milicias confederales de la Región Centro. Formó parte del grupo que, en nombre de la CNT, se incautó del Colegio de Médicos de Madrid en julio de 1936.
Durante la contienda ocupó cargos de enorme responsabilidad:
Especialista en defensa química, publicó textos sobre protección civil frente a armas químicas y biológicas y fue creador e inspector general de la Brigada Antigás.
En agosto de 1938 fue designado delegado de Sanidad Nacional ante la Generalitat de Cataluña.
Al finalizar la guerra se exilió en París, donde trabajó en el Servicio de Evacuación de la República Española (SERE). Posteriormente emigró a México, donde colaboró en la fundación de la seguridad social.
Vivió también en Cuba, regresando después a México y, finalmente, en 1963, volvió a España. Desde 1964 ejerció como médico titular en Alcalá de Henares.
Publicó un libro de memorias sobre la Guerra Civil, testimonio de su intensa actividad sanitaria y política.
Su trayectoria refleja:
Juan Morata Cantón fue una figura clave del sanitarismo libertario español. Su papel en la organización de la sanidad republicana, su compromiso político y su labor médica en el exilio lo convierten en uno de los profesionales más relevantes del ámbito sanitario anarquista del siglo XX.